Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh1a2Q62148 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh1a2Q62148 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh1a2Q62148 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh1a2Q62148 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh1a2Q62148 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms