Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PapolaQ61183 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PapolaQ61183 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PapolaQ61183 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolaQ61183 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms