Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Epha1Q60750 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha1Q60750 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Epha1Q60750 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha1Q60750 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms