Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sco1Q5SUC9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sco1Q5SUC9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sco1Q5SUC9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sco1Q5SUC9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sco1Q5SUC9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms