Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cacna2d4Q5RJF7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cacna2d4Q5RJF7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cacna2d4Q5RJF7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cacna2d4Q5RJF7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms