Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc8bQ5DU41 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc8bQ5DU41 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms