Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Samd5Q3V1H9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Samd5Q3V1H9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Samd5Q3V1H9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd5Q3V1H9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1678 ms