Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ulk3Q3U3Q1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ulk3Q3U3Q1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ulk3Q3U3Q1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms