Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rtl9Q32KG4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rtl9Q32KG4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtl9Q32KG4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl9Q32KG4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms