Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb8Q0VBD0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itgb8Q0VBD0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itgb8Q0VBD0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb8Q0VBD0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms