Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C2orf54Q08AI8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2orf54Q08AI8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2orf54Q08AI8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C2orf54Q08AI8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms