Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NrepQ07475 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NrepQ07475 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrepQ07475 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NrepQ07475 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NrepQ07475 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NrepQ07475 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms