Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 PTH2YBL057C 627 nt6.1□□□□□ -1.43
SSK1Q07084 YOR300WYOR300W 309 nt6.1□□□□□ -1.43
SSK1Q07084 BRN1YBL097W 2265 nt6.09□□□□□ -1.43
SSK1Q07084 NPL6YMR091C 1308 nt6.09□□□□□ -1.43
SSK1Q07084 YJR107WYJR107W 987 nt6.09□□□□□ -1.43
SSK1Q07084 SPG5YMR191W 1122 nt6.09□□□□□ -1.43
SSK1Q07084 PZF1YPR186C 1290 nt6.09□□□□□ -1.43
SSK1Q07084 NOG2YNR053C 1461 nt6.09□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 TKL2YBR117C 2046 nt6.08□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 MPE1YKL059C 1326 nt6.08□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 DPH5YLR172C 903 nt6.08□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 AIM33YML087C 939 nt6.08□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 FCY22YER060W-A 1593 nt6.08□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 SNU71YGR013W 1863 nt6.08□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 NAF1YNL124W 1479 nt6.08□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 COS10YNR075W 1125 nt6.07□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 AIM3YBR108W 2844 nt6.07□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 PDA1YER178W 1263 nt6.06□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 QCR6YFR033C 444 nt6.06□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 REC107YJR021C 945 nt6.06□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 NTG2YOL043C 1143 nt6.06□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 CST26YBR042C 1194 nt6.06□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 YPR130CYPR130C 408 nt6.06□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 CIT3YPR001W 1461 nt6.06□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 AVT4YNL101W 2142 nt6.05□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 TUB1YML085C 1344 nt6.05□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 HIS1YER055C 894 nt6.05□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 CBR1YIL043C 855 nt6.05□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 YHC3YJL059W 1227 nt6.05□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 YNL200CYNL200C 741 nt6.05□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 YDL177CYDL177C 513 nt6.04□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 MRPS28YDR337W 861 nt6.04□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 YSC83YHR017W 1158 nt6.04□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 YKR032WYKR032W 315 nt6.04□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 YOX1YML027W 1158 nt6.04□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 GPA1YHR005C 1419 nt6.04□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 ARG81YML099C 2643 nt6.04□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 YDR415CYDR415C 1125 nt6.03□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 RPL31BYLR406C 342 nt6.03□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 IRC11YOR013W 471 nt6.03□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 GET4YOR164C 939 nt6.03□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 YCL049CYCL049C 939 nt6.03□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 HXT2YMR011W 1626 nt6.03□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 APE4YHR113W 1473 nt6.02□□□□□ -1.44
SSK1Q07084 YMR034CYMR034C 1305 nt6.02□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 YBR284WYBR284W 2394 nt6.02□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 TOS6YNL300W 309 nt6.02□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 ZIM17YNL310C 525 nt6.02□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 SES1YDR023W 1389 nt6.02□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 PTC7YHR076W 1032 nt6.01□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 snR30snR30 606 nt6.01□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 SUF16tG(GCC)C 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 TRR2YHR106W 1029 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 PRS4YBL068W 981 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 HTZ1YOL012C 405 nt6□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 DML1YMR211W 1428 nt5.99□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 CEF1YMR213W 1773 nt5.99□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 YPT1YFL038C 621 nt5.99□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 HGH1YGR187C 1185 nt5.99□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 YHR145CYHR145C 357 nt5.99□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 ERP2YAL007C 648 nt5.99□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 URA1YKL216W 945 nt5.99□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 YNR005CYNR005C 405 nt5.99□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 DFR1YOR236W 636 nt5.99□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 STT3YGL022W 2157 nt5.99□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.98□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 ORM1YGR038W 669 nt5.98□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 MCP1YOR228C 909 nt5.98□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 HEM1YDR232W 1647 nt5.98□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 KNS1YLL019C 2214 nt5.98□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 CIA1YDR267C 993 nt5.97□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 HEM2YGL040C 1029 nt5.97□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 COX5AYNL052W 462 nt5.97□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 YBR113WYBR113W 483 nt5.97□□□□□ -1.45
SSK1Q07084 AIM46YHR199C 933 nt5.96□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 PRI1YIR008C 1230 nt5.96□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 YUR1YJL139C 1287 nt5.96□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 CYC8YBR112C 2901 nt5.96□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 PMT3YOR321W 2262 nt5.96□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 YHR020WYHR020W 2067 nt5.95□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 NMT1YLR195C 1368 nt5.95□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 FET4YMR319C 1659 nt5.95□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 ISC1YER019W 1434 nt5.95□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 SHO1YER118C 1104 nt5.95□□□□□ -1.46
SSK1Q07084 ATG36YJL185C 882 nt5.95□□□□□ -1.46
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