Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt7.08□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 MIF2YKL089W 1650 nt7.08□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 SMF3YLR034C 1422 nt7.08□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 VRP1YLR337C 2454 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 PMT3YOR321W 2262 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 WTM1YOR230W 1314 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 DIP5YPL265W 1827 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YEL028WYEL028W 462 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 OKP1YGR179C 1221 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 JJJ3YJR097W 519 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 MED4YOR174W 855 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 ATP4YPL078C 735 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 RGT2YDL138W 2292 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 PRC1YMR297W 1599 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 MFG1YDL233W 1377 nt7.07□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 ATP2YJR121W 1536 nt7.06□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 WSC3YOL105C 1671 nt7.06□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 MMR1YLR190W 1476 nt7.06□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 CHA1YCL064C 1083 nt7.06□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 MFT1YML062C 1179 nt7.06□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 BAG7YOR134W 1230 nt7.06□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 AFG2YLR397C 2343 nt7.06□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 EDC2YER035W 438 nt7.05□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YGL101WYGL101W 648 nt7.05□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 RSF1YMR030W 1131 nt7.05□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 HRT1YOL133W 366 nt7.05□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 MRN1YPL184C 1839 nt7.05□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YER138W-AYER138W-A 105 nt7.04□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 ADH4YGL256W 1149 nt7.04□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 SAY1YGR263C 1275 nt7.04□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YLR402WYLR402W 192 nt7.04□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 ERV41YML067C 1059 nt7.04□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YMR206WYMR206W 942 nt7.04□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 NCE103YNL036W 666 nt7.04□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt7.04□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YFL052WYFL052W 1398 nt7.04□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 MSP1YGR028W 1089 nt7.03□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 PRE10YOR362C 867 nt7.03□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 GDH1YOR375C 1365 nt7.03□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 ELP4YPL101W 1371 nt7.03□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 YPR084WYPR084W 1371 nt7.03□□□□□ -1.28
HDA2Q06629 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.02□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.02□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.02□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.02□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.02□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.02□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.02□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 KAE1YKR038C 1161 nt7.02□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 SPE4YLR146C 903 nt7.02□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 LIP2YLR239C 987 nt7.02□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 HXT8YJL214W 1710 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 YNL247WYNL247W 2304 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 CIT2YCR005C 1383 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 KTR4YBR199W 1395 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 ARO3YDR035W 1113 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 TAD2YJL035C 753 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 ARC35YNR035C 1029 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 TIM50YPL063W 1431 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 ERR3YMR323W 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 ERR1YOR393W 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 ERR2YPL281C 1314 nt7.01□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 WSC4YHL028W 1818 nt7□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 RRP17YDR412W 708 nt7□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 DUO1YGL061C 744 nt7□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 YGR283CYGR283C 1026 nt7□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt7□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 TAZ1YPR140W 1146 nt7□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 JHD1YER051W 1479 nt6.99□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 YIL108WYIL108W 2091 nt6.99□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 GET3YDL100C 1065 nt6.99□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 MRP13YGR084C 1020 nt6.99□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 SNP1YIL061C 903 nt6.99□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 ERP2YAL007C 648 nt6.99□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 YPL014WYPL014W 1146 nt6.99□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 AGP2YBR132C 1791 nt6.99□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 KAR1YNL188W 1302 nt6.99□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 MGR3YMR115W 1506 nt6.98□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 RTT103YDR289C 1230 nt6.98□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 CTL1YMR180C 963 nt6.98□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 DCP1YOL149W 696 nt6.98□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 RDL1YOR285W 420 nt6.98□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 TCA17YEL048C 459 nt6.97□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 YHR054CYHR054C 1065 nt6.97□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 EFM3YJR129C 1020 nt6.97□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 PMU1YKL128C 888 nt6.97□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 PML1YLR016C 615 nt6.97□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 YMR253CYMR253C 1245 nt6.97□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 YIP3YNL044W 531 nt6.97□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 SNN1YNL086W 309 nt6.97□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 HOG1YLR113W 1308 nt6.97□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 DAL7YIR031C 1665 nt6.96□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 VPS72YDR485C 2388 nt6.96□□□□□ -1.29
HDA2Q06629 PEX7YDR142C 1128 nt6.96□□□□□ -1.3
HDA2Q06629 YGR011WYGR011W 327 nt6.96□□□□□ -1.3
HDA2Q06629 ADE1YAR015W 921 nt6.96□□□□□ -1.3
HDA2Q06629 CDA2YLR308W 939 nt6.96□□□□□ -1.3
HDA2Q06629 MTG1YMR097C 1104 nt6.96□□□□□ -1.3
HDA2Q06629 JNM1YMR294W 1122 nt6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36 ms