Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp9bP98195 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp9bP98195 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9bP98195 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp9bP98195 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms