Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdrg1P59048 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdrg1P59048 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdrg1P59048 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdrg1P59048 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms