Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApodP51910 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApodP51910 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApodP51910 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApodP51910 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApodP51910 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ApodP51910 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ApodP51910 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApodP51910 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApodP51910 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApodP51910 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApodP51910 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ApodP51910 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ApodP51910 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ApodP51910 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApodP51910 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApodP51910 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ApodP51910 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApodP51910 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApodP51910 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApodP51910 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApodP51910 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApodP51910 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApodP51910 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApodP51910 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApodP51910 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApodP51910 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApodP51910 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApodP51910 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApodP51910 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApodP51910 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApodP51910 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApodP51910 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApodP51910 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApodP51910 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApodP51910 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApodP51910 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApodP51910 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApodP51910 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApodP51910 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApodP51910 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApodP51910 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApodP51910 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApodP51910 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ApodP51910 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApodP51910 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApodP51910 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApodP51910 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApodP51910 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApodP51910 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApodP51910 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ApodP51910 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ApodP51910 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApodP51910 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ApodP51910 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApodP51910 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApodP51910 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApodP51910 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApodP51910 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ApodP51910 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApodP51910 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApodP51910 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApodP51910 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApodP51910 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApodP51910 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ApodP51910 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApodP51910 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApodP51910 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApodP51910 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApodP51910 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApodP51910 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ApodP51910 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ApodP51910 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApodP51910 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApodP51910 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApodP51910 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApodP51910 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ApodP51910 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ApodP51910 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApodP51910 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ApodP51910 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApodP51910 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApodP51910 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApodP51910 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApodP51910 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApodP51910 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ApodP51910 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ApodP51910 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ApodP51910 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApodP51910 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApodP51910 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApodP51910 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ApodP51910 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApodP51910 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApodP51910 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApodP51910 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ApodP51910 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApodP51910 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApodP51910 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ApodP51910 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms