Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccnd3P30282 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccnd3P30282 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccnd3P30282 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccnd3P30282 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms