Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gjb1P28230 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gjb1P28230 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gjb1P28230 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gjb1P28230 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gjb1P28230 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms