Protein–RNA interactions for Protein: P16294

F9, Coagulation factor IX, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P16294 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
F9P16294 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P16294 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P16294 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P16294 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P16294 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P16294 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P16294 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P16294 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P16294 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P16294 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P16294 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P16294 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P16294 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P16294 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P16294 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P16294 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P16294 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P16294 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P16294 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P16294 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P16294 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P16294 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P16294 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P16294 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P16294 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P16294 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P16294 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P16294 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P16294 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P16294 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P16294 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P16294 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P16294 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P16294 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P16294 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
F9P16294 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P16294 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P16294 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P16294 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F9P16294 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P16294 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P16294 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F9P16294 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P16294 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P16294 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P16294 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
F9P16294 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P16294 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P16294 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P16294 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P16294 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F9P16294 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P16294 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P16294 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P16294 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P16294 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F9P16294 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F9P16294 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F9P16294 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
F9P16294 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P16294 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P16294 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P16294 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P16294 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F9P16294 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P16294 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P16294 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P16294 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P16294 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
F9P16294 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P16294 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P16294 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P16294 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P16294 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F9P16294 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P16294 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P16294 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P16294 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P16294 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P16294 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F9P16294 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P16294 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P16294 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F9P16294 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P16294 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P16294 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F9P16294 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P16294 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P16294 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P16294 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F9P16294 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P16294 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F9P16294 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P16294 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P16294 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P16294 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P16294 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P16294 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F9P16294 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms