Protein–RNA interactions for Protein: P09240

Cck, Cholecystokinin, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckP09240 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckP09240 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckP09240 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckP09240 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckP09240 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckP09240 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckP09240 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckP09240 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckP09240 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckP09240 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckP09240 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckP09240 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckP09240 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckP09240 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckP09240 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckP09240 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckP09240 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckP09240 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckP09240 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckP09240 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckP09240 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckP09240 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckP09240 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckP09240 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckP09240 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckP09240 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckP09240 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckP09240 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckP09240 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckP09240 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckP09240 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckP09240 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckP09240 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckP09240 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckP09240 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckP09240 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckP09240 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckP09240 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckP09240 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckP09240 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckP09240 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckP09240 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckP09240 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckP09240 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckP09240 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckP09240 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckP09240 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckP09240 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckP09240 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckP09240 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckP09240 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckP09240 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckP09240 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CckP09240 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckP09240 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckP09240 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckP09240 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckP09240 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CckP09240 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckP09240 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckP09240 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckP09240 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckP09240 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CckP09240 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckP09240 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckP09240 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CckP09240 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckP09240 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckP09240 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckP09240 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckP09240 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckP09240 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CckP09240 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckP09240 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckP09240 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckP09240 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckP09240 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckP09240 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckP09240 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckP09240 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CckP09240 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.9 ms