Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01896 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01896 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01896 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01896 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01896 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01896 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01896 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01896 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01896 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01896 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01896 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01896 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01896 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01896 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01896 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01896 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01896 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01896 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01896 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01896 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01896 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01896 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01896 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01896 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P01896 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01896 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01896 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01896 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01896 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01896 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01896 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01896 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P01896 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01896 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01896 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01896 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01896 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01896 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01896 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01896 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01896 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01896 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01896 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01896 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01896 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01896 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01896 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01896 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01896 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01896 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01896 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01896 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01896 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01896 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01896 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01896 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01896 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01896 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01896 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01896 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01896 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01896 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01896 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01896 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01896 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01896 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01896 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01896 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01896 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01896 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01896 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01896 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01896 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01896 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01896 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01896 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01896 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01896 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01896 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01896 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01896 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01896 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01896 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01896 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01896 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01896 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01896 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01896 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01896 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01896 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01896 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01896 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01896 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01896 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01896 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01896 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01896 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01896 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01896 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms