Protein–RNA interactions for Protein: O70338

Rnaseh1, Ribonuclease H1, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh1O70338 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnaseh1O70338 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnaseh1O70338 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnaseh1O70338 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnaseh1O70338 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnaseh1O70338 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rnaseh1O70338 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms