Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IlkO55222 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IlkO55222 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IlkO55222 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IlkO55222 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IlkO55222 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IlkO55222 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IlkO55222 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IlkO55222 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IlkO55222 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IlkO55222 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IlkO55222 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IlkO55222 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IlkO55222 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IlkO55222 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IlkO55222 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IlkO55222 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
IlkO55222 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IlkO55222 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IlkO55222 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IlkO55222 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IlkO55222 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IlkO55222 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IlkO55222 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IlkO55222 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IlkO55222 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IlkO55222 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IlkO55222 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IlkO55222 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IlkO55222 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IlkO55222 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IlkO55222 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IlkO55222 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IlkO55222 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IlkO55222 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IlkO55222 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IlkO55222 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IlkO55222 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IlkO55222 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IlkO55222 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IlkO55222 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IlkO55222 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IlkO55222 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IlkO55222 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IlkO55222 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IlkO55222 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IlkO55222 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IlkO55222 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IlkO55222 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IlkO55222 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IlkO55222 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IlkO55222 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IlkO55222 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IlkO55222 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IlkO55222 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IlkO55222 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IlkO55222 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IlkO55222 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IlkO55222 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IlkO55222 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IlkO55222 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IlkO55222 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IlkO55222 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IlkO55222 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IlkO55222 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IlkO55222 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IlkO55222 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IlkO55222 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IlkO55222 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IlkO55222 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IlkO55222 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IlkO55222 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IlkO55222 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IlkO55222 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IlkO55222 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IlkO55222 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IlkO55222 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IlkO55222 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IlkO55222 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IlkO55222 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IlkO55222 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IlkO55222 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IlkO55222 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IlkO55222 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IlkO55222 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IlkO55222 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IlkO55222 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IlkO55222 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IlkO55222 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IlkO55222 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IlkO55222 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IlkO55222 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IlkO55222 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IlkO55222 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IlkO55222 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IlkO55222 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IlkO55222 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IlkO55222 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IlkO55222 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IlkO55222 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms