Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ptpn9O35239 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ptpn9O35239 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptpn9O35239 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ptpn9O35239 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ptpn9O35239 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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