Protein–RNA interactions for Protein: J3QNQ5

Btbd35f24, BTB domain-containing 35, family member 24, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f24J3QNQ5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Btbd35f24J3QNQ5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Btbd35f24J3QNQ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Btbd35f24J3QNQ5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Btbd35f24J3QNQ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms