Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm21972J3QN38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21972J3QN38 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21972J3QN38 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 774 ms