Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Usp17ldG5E8G2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp17ldG5E8G2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp17ldG5E8G2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Usp17ldG5E8G2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp17ldG5E8G2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp17ldG5E8G2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp17ldG5E8G2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Usp17ldG5E8G2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms