Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ScaperF8VQ70 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ScaperF8VQ70 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ScaperF8VQ70 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ScaperF8VQ70 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ScaperF8VQ70 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms