Protein–RNA interactions for Protein: F6VBM2

Gm10490, Predicted gene 10490, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10490F6VBM2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm10490F6VBM2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm10490F6VBM2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10490F6VBM2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms