Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppfia4B8QI36 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppfia4B8QI36 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppfia4B8QI36 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppfia4B8QI36 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms