Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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