Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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ARL2-SNX15V9GYD0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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