Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RHBDD3Q9Y3P4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms