Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UTP11Q9Y3A2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms