Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SETD1BQ9UPS6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SETD1BQ9UPS6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms