Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRPC4Q9UBN4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRPC4Q9UBN4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms