Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCDC180Q9P1Z9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CCDC180Q9P1Z9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms