Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ERVK13-1Q9NX77 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVK13-1Q9NX77 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms