Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NRIP3Q9NQ35 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms