Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms