Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf2a1Q99PM3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf2a1Q99PM3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms