Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIC2Q96JB3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HIC2Q96JB3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms