Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP43Q70EL4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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