Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
C16orf54Q6UWD8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms