Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DbpQ60925 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DbpQ60925 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DbpQ60925 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DbpQ60925 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms