Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HSD17B12Q53GQ0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms