Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SKIDA1Q1XH10 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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