Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SQLEQ14534 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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