Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SP140Q13342 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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SP140Q13342 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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SP140Q13342 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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SP140Q13342 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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SP140Q13342 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SP140Q13342 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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